Родился 11 ноября 1921 года в с. Карланюрт Хасавюртовского округа Дагестанской АССР в многодетной кумыкской семье (родители Джумагулова имели 15 детей. Получил неполное среднее образование, трудился в колхозе. В 1940 году окончил курсы ветеринарных фельдшеров. В ряды Красной армии был призван в 1940 году. В период прохождения службы, Джумагулов выучился на механика-водителя танка Т-26. На этой должности Джумагулова застало начало Великой Отечественной войны.
За время войны побывал механиком-водителем, затем командиром танка, и командиром танкового взвода. В 1942 году окончил курсы младших лейтенантов. Воевал на Юго-Западном, Ленинградском, Западном, Брянском, Центральном, Белорусском, 1-м Белорусском фронтах. Участвовал:
- в оборонительных боях на Украине, в том числе в танковом сражении в районе города Дубно, в контрударах в районе городов Новоград-Волынский, Малин, в бою в районе города Шлиссельбург — в 1941 году;
- в боях в районе посёлка Новосиль Орловской области — в 1942;
- в Воронежско-Касторненской операции, в боях на Курской дуге, в том числе в обороне города Малоархангельск и освобождении станции Змиёвка, в Брянской и Гомельско-Речицкой операциях, в том числе в освобождении посёлков Суземка, Злынка, города Гомель, в боях юго-восточнее города Жлобин — в 1943;
- в боях на реке Днепр в районе города Рогачёв, в Белорусской операции, в том числе в освобождении города Бобруйск — в 1944.
В районе г. Бобруйск два танка Т-34 под командованием Джумагулова быстро продвинулись в глубину вражеской обороны. Им удалось перерезать шоссе Рогачёв — Бобруйск. В ходе боя на шоссе экипажи двух танков уничтожили около 100 солдат, офицеров противника, 3 батареи противотанковой обороны. В этом бою танк Джумагулова был подбит. Он же был ранен и получил тяжёлые ожоги, но несмотря на это, он и экипаж танка, вооружившись автоматами, гранатами, бросились в траншею противника и вступили в рукопашный бой с немецкими автоматчиками. Танкисты, перекрыв движение по шоссе, продержались до подхода стрелковых подразделений и основных сил полка, чем способствовали успешному наступлению частей на Бобруйск, в районе которого была в конечном итоге окружена крупная гитлеровская группировка.
Указом Президиума Верховного Совета СССР от 26 сентября 1944 года за образцовое выполнение боевых заданий командования на фронте борьбы с немецко-фашистскими захватчиками и проявленные при этом мужество и героизм старшему лейтенанту Джумагулову Эльмурзе Биймурзаевичу присвоено звание Героя Советского Союза с вручением ордена Ленина и медали «Золотая Звезда».
В 1945 году окончил Ленинградскую высшую бронетанковую школу, в 1958 году — Курсы усовершенствования офицерского состава. В послевоенное время судьба Джумагулова тоже оказалась связанной с воинской службой. С 1958 года он возглавлял военные комиссариаты Кизилюртовского, Бабаюртовского, Хасавюртовского районов Республики Дагестан, а после выхода в запас в 1973 году, работал председателем сельского Совета депутатов в родном селении Карланюрт.
Проживал в городе Хасавюрт. Скончался 26 сентября 2013 года на 92-м году жизни в Махачкале.
Награды:
Медаль «Золотая Звезда» Героя Советского Союза.
Орден Ленина.
Два Ордена Красного Знамени.
Орден Отечественной войны I степени.
Два Ордена Красной звезды.
Медали.
Память:
Почётный гражданин города Рогачёв.
Имя Джумагулова Э.Б. носят школы в селе Аксай и в городе Хасавюрт.
Подвигу героя кумыкские писатели (Аткай, Гебек Конакбиев и др.) посвятили несколько книг.
В честь Джумагулова в городе Хасавюрте по инициативе администрации установлен памятник (танк «Т-72»).